认识 R 包
R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。 学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。 包的使用是一通百通的，我们以dplyr为例，讲一下R包。
安装和加载R包
1.镜像设置
为了保证我们可以自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像，其实是可以在Rstudio中进行设置的，只需要运行这两行代码即可：
代码语言：txt
复制
# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
# 当然可以换成其他地区的镜像options()$BioC_mirror 查看镜像地址
2.安装
R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)。取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor，存在于哪里？可以谷歌搜到。
加载
library(dplyr)
示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:
test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
dplyr五个基础函数
1.mutate(),新增列
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
2.select(),按列筛选
(1)按列号筛选
(2)按列名筛选
3.filter()筛选行
4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
5.summarise()：汇总
dplyr两个实用技能
管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
count统计某列的unique值
dplyr处理关系数据
