摘要:
计算两个小分子之间的RMSD,可以用来判断两个构象的接近程度。
方法:
1
安装Anaconda
Win或Linux系统下安装Anaconda
2
安装RDKit
conda install -c rdkit rdkit
3
RMSD脚本使用
python isoRMSD.py mol1.pdb mol2.pdb rmsd.txt
阅读原文,查看详细的isoRMSD.py脚本。
摘要:
计算两个小分子之间的RMSD,可以用来判断两个构象的接近程度。
方法:
1
安装Anaconda
Win或Linux系统下安装Anaconda
2
安装RDKit
conda install -c rdkit rdkit
3
RMSD脚本使用
python isoRMSD.py mol1.pdb mol2.pdb rmsd.txt
阅读原文,查看详细的isoRMSD.py脚本。