miniconda

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一、下载

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https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/

复制最新版本链接（64位）

登录linux服务器

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cd ~/biosoft
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wget 链接

二、安装

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bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

安装成功可见：

Thank you for installing Miniconda3!

三、激活

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source ~/.bashrc

验证激活：

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conda

输出信息则证明激活成果

若激活失败，删除目录，从 二、安装 步骤开始重新进行

四、添加镜像网站

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conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

五、使用

1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表

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conda list

2、安装fastqc软件

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conda install fastqc -y

安装指定版本

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conda install fastqc=0.11.7 -y

验证fastqc软件是否安装成功

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fastqc --help

输出内容，则安装成功

3、conda environment

查看：

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conda info --envs

建立新环境

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conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

激活新环境

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conda activate rna-seq

验证新环境

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fastqc

输出信息，则证明已激活

注意：

1、左键复制，右键粘贴（windows）

2、Tab可用于补齐

3、q ——quit 跳过

4、在代码后加 -y 可用于回答运行中所有的yes or no，提高效率

#conda