LDSC是一个用python语言编写的程序，可以使用GWAS的summary结果，计算遗传力，遗传相关以及LD 得分，功能强大，应用广泛。

GWAS和GS分析中，都有一个假定：「假定至少有一个SNP标记与所控制性状的QTL（基因）处于连锁不平衡状态（LD）」，那怎么满足这个条件呢，就需要覆盖全基因组的标记，需要计算群体LD的衰减距离，进而计算进行GWAS分析时所需要的最少SNP的个数。

大家好，我是邓飞，对于动植物育种而言，我之前写过PRS和MAS以及GS的关系，有老师评论说PRS更类似GS，因为它可以利用已有的GWAS信息，直接预测候选群的表型，如果按照动植物的GS方法，几十万几百万的样本做GS显然不现实，而PRS提供了这种思路，就可以利用已有的GWAS结果，通过一些质控，来预测候选群的表现（目标群体的风险得分）。

‍无论是在进行全基因组关联研究（GWAS）还是孟德尔随机化研究（MR）中，我们都需要考虑SNP间的连锁不平衡（LD）信息，这里小陈给大家简单介绍一下用于LD分析的工具-----LDlink（https

GWAS Catalog是EBI旗下的一个数据库，收录了公开发表的GWAS分析结果，截止2019-11-21，收录了16万个SNP位点和疾病之间的关联信息，更多信息汇总如下