我布置了一个作业，让大家可以尝试把cox可以火山图为什么gsea结果不行 这个里面的数据集 GSE101668 ，里面的表达矩阵，进行热图可视化，很多同学完成了作业，我随机挑选其中一个学徒的优秀笔记跟大家分享！

今天的是三周合计15天的数据挖掘授课学员一点一滴整理的授课知识点笔记哦，还有互动练习题哈，欢迎大家点击文末的阅读原文去关注我们学员的公众号哦！

以GSE111229为例 方法一 1 下载并保存GEO数据 下载有error可以：设置镜像、访问外国网站、rm(list=ls（）)一下重试… library(GEOquery) GSE_name = 'GSE111229' options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' ) #windows系统 gset <- getGEO( GSE_name, getGPL = F ) save( gset, file = 'gset.R

生信技能树学习笔记制作string输入数据打开string网站Cytoscape属性表格导入网络文件按照logFC设置填充颜色Cytohubba找hub基因MCODE找子网络

最近发现了一个专门收集整理了肿瘤转移数据的数据库工具——HCMDB，网址：http://hcmdb.i-sanger.com/index。该工具由华东师范大学的董东教授于2017年发表于著名的《Nucleic Acids Research》，影响因子11.147分。

官方文档:https://pyecharts.org/#/zh-cn/quickstart Python使用Pyecharts画Geo地图，如何显示具体地点名称 pyecharts世界地图用：国家中英文对照表.xlsx Map中的地理坐标问题