以MNTD（mean-nearest-taxon-distance）和NTI（nearest-taxon-index）为例，其他系统发育多样性指数类似：

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数据集选用TspLIB中的gr48。 注：数据集中包含每一组的最优解和最优解城市编码。

在NLP中，我们经常要比较两个句子的相似度，其标准方法是将句子编码为固定大小的向量，然后用某种几何距离（欧氏距离、cos距离等）作为相似度。这种方案相对来说比较简单，而且检索起来比较快速，一定程度上能满足工程需求

文件跳转较多，新手读起代码可能有点吃力。最好记录下每个文件是干什么的，有个大致印象即可。

两个集合A和B交集元素的个数在A、B并集中所占的比例，称为这两个集合的杰卡德系数，用符号 J(A,B) 表示。

原文在这里：https://medium.com/@n83072/dynamic-time-warping-dtw-cef508e6dd2d

相信通过以上程序，能够很好的理解topLine，buttomLine，baseLine，ascentLine，descentLine。 另外：Paint类有两个方法

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这一部分 Lecture 讲的内容，与计算机网络有一定重合，这里笔记偏向于在系统设计中需要考虑的概念，而至于具体的协议、网络通信的具体细节等，即使在 lecture 视频中提到了，也不会记录到笔记中。这一部分细节可以通过计算机网络课程学习。